La solucion al final es muy sencilla, no es que se cambie solo de SI a NO, el tema es que el plugin tiene un error y no esta salvando correctamente el option en la BD.
Lo que yo hice para solucionar es insertar el option manualmente en la BD.
En el codigo del plugin de mercado pago encotre que el option se llama: checkout_credential_prod
Insertarlo en la tabla wp_options con el valor yes
Espero les sirva por que mercado pago no sirve para una M en temas de soporte.
Saludos!!